Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NDC1Q9BTX1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms