Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTKNQ9BST9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms