Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF1Q9BSM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms