Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF559Q9BR84 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF559Q9BR84 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms