Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VGLL1Q99990 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VGLL1Q99990 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms