Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRQ99707 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTRQ99707 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTRQ99707 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTRQ99707 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTRQ99707 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRQ99707 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRQ99707 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRQ99707 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRQ99707 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRQ99707 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRQ99707 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms