Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1Q99675 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1Q99675 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms