Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NAP1L3Q99457 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NAP1L3Q99457 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms