Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP2Q96SN8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK5RAP2Q96SN8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms