Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN18Q96SJ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms