Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
IFT140Q96RY7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
IFT140Q96RY7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IFT140Q96RY7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms