Protein–RNA interactions for Protein: Q96RU7

TRIB3, Tribbles homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIB3Q96RU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIB3Q96RU7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIB3Q96RU7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms