Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMKK2Q96RR4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CAMKK2Q96RR4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms