Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCNAQ96QF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms