Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC4A9Q96Q91 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC4A9Q96Q91 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms