Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LMTK3Q96Q04 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LMTK3Q96Q04 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LMTK3Q96Q04 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms