Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC85AQ96PX6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC85AQ96PX6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC85AQ96PX6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms