Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA5Q96PV4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms