Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF3Q96PU9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF3Q96PU9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms