Protein–RNA interactions for Protein: Q96P71

NECAB3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB3Q96P71 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NECAB3Q96P71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NECAB3Q96P71 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms