Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP3Q96P47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP3Q96P47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms