Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RILPQ96NA2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RILPQ96NA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms