Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF560Q96MR9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF560Q96MR9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms