Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPOR3Q96MK2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPOR3Q96MK2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms