Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMTD1Q96MG8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMTD1Q96MG8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms