Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHAMP1Q96JM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHAMP1Q96JM3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms