Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COG3Q96JB2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COG3Q96JB2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COG3Q96JB2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms