Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCD1Q96GM5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms