Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPACA9Q96E40 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPACA9Q96E40 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms