Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMD3Q96D46 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMD3Q96D46 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms