Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SYTL4Q96C24 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYTL4Q96C24 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYTL4Q96C24 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms