Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC17Q96AE7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC17Q96AE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms