Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HDAC10Q969S8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC10Q969S8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC10Q969S8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms