Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOP1MTQ969P6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TOP1MTQ969P6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms