Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAVIN3Q969G5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAVIN3Q969G5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms