Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP13Q92995 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP13Q92995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP13Q92995 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP13Q92995 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP13Q92995 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP13Q92995 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP13Q92995 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms