Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DHX38Q92620 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DHX38Q92620 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX38Q92620 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DHX38Q92620 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms