Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM3CQ92520 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM3CQ92520 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms