Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL1Q8WXF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATL1Q8WXF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms