Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOBEC4Q8WW27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOBEC4Q8WW27 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms