Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC12Q8WVT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAPPC12Q8WVT3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms