Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STAG1Q8WVM7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STAG1Q8WVM7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STAG1Q8WVM7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms