Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFT2D1Q8WV19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms