Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HELQQ8TDG4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms