Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBA3Q8TBC4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA3Q8TBC4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms