Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HELBQ8NG08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms