Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYRIPQ8NFW9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYRIPQ8NFW9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms