Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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TMIEQ8NEW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TMIEQ8NEW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMIEQ8NEW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMIEQ8NEW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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