Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CARMIL3Q8ND23 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CARMIL3Q8ND23 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms