Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC63Q8NA47 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms